前沿学科交叉研究院实行学校领导下的院长负责制。对已有架构作如下改革，以使研究院高效有序运作。

研究院设院长1名，副院长1-2名，行政秘书和科研与项目管理主任各1人。工作人员若干名。其组织架构如下图所示。研究院下设管理办公室，负责拟定研究院章程、制定年度目标任务、与学校的沟通衔接及日常运营工作。

研究院设有8个研究平台，包括现有的7个研究平台和冰上运动设备研究平台。研究院将新设立学术委员会，设主任委员1人，副主任委员1人，成员若干。成员包括研究院内部机构负责人、教授以及校外专家教授，其中外部专家数量不少于50%。